仏塔薬師堂には上野東照宮の本地堂に安置されていた日光・月光の二菩薩を脇侍とする薬師三尊が安置されています。
薬師如来は人々の病苦や心の苦悩を取り除いてくれる仏さまとして知られ、諸病平癒のご利益を授けてくださると信仰を集めています。
また薬師三尊は事業繁栄のご利益もあるとされ、ﾊﾟｺﾀﾞをｲﾝﾄﾞまで行って研究、造立した建築会社が急速に躍進したとか、出開帳先の地元百貨店の売り上げが伸びたとかという噂もあります。薬師三尊は毎月8日、18日に直接拝むことができます。