一説によると、徳川家康が江戸に幕府を開くより前に、奈良の吉野山にある蔵王堂境内の導稲荷を勧請したとされる新宿地区の総鎮守。
以前は花園稲荷神社と呼ばれていましたが、1965年（昭和40）に末社であった大鳥神社を合祀し、花園神社に改称されました。
祭神の倉稲魂神、日本武尊、受持神のご神徳により、開運招福、商売繁盛などのご利益があるといわれ信仰を集めています。